警视厅搜查一科的刑警城崎达彦和搭档笹塚晋平一起，作为检举率No.1的拍档活跃着。然而有一天，城崎最爱的妻子惠子突然失踪。接着，发现了惠子的前辈，一位自由记者的尸体，城崎确信惠子卷入了事件中，但警方却不愿展开调查，甚至城崎还被排除在调查之外。对警方的不合理应对感到愤怒的城崎辞职后，为了亲自找出惠子，成立了专门处理失踪案件的侦探社“失踪人员搜索班”。由各领域的专业人士组成的个性鲜明的成员们，以及最重要的助手笹塚一起追踪惠子和他们的下落，逐渐揭示了可以称之为社会巨大黑暗的“消失的真相”。