当一次本土的恐怖袭击震惊了波士顿，该市的联邦调查局外地办事处立即行动起来，寻找肇事者。特别探员尼克-杜兰（Nick Durand）与主管探员德里克-克朗（Derek Crown）和新的分析员特别探员朱莉安-古纳森（Julianne Gunnarsen）一起领导对国内恐怖分子的搜寻工作。与此同时，Emily对自己过去的调查变成了对一个连环杀手的追捕，这个杀手的罪行在整个城市的混乱中被忽略了。当连环杀手杀害了与Emily关系密切的受害者时，她回到联邦调查局追捕他，并与特别探员Cal Isaac合作，后者曾是海豹突击队队员，性格与Emily相反。