在第二季中，进取号继续穿越银河系的旅程，并出现了一位新成员。皮卡德再次带领团队，因为未知的文明注意到这艘船，并希望了解更多关于船员和他们的操作。瑞克的生命受到威胁，他与自己对进取号的忠诚作斗争，数据试图变得更人性化，以理解他在进取号上的角色。这一季更深入地探讨了人类与机器的关系，Q 再次试图考验皮卡德对抗一个新的敌人。费伦吉威胁着进取号，全息甲板的神秘使船员们争分夺秒，生命危在旦夕。